Están centralizados en la Sede de Punchana y desde allí animan facetas específicas de la misión:
CÁRITAS SAN JOSÉ
DEPARTAMENTO DE PASTORAL DE LA SALUD
OFICINA DE DERECHOS HUMANOS
ANIMACIÓN BÍBLICA DE LA PASTORAL
ANIMACIÓN MISIONERA Y OMP
ODEC (Oficina Diocesana de Educación Católica) MAYNAS
ODEC RAMÓN CASTILLA
